日本鬼父第三季 花鼠染色体水平基因组初次破译告捷

日本鬼父第三季 花鼠染色体水平基因组初次破译告捷

  【科技前沿】日本鬼父第三季

  光明日报呼和浩特1月5日电 记者高平、王潇从内蒙古自治区科技厅获悉,近日,赤峰学院农学院相吉山商榷员科研团队聚拢曲阜师范大学生命科学学院易现峰解说团队初次破译了花鼠的染色体水平基因组,告捷拼装了宇宙第一个花鼠属物种的染色体水平基因组。该商榷取得了国度当然科学基金的支撑,商榷效果在国际期刊《科学数据》(Scientific Data)在线发表。

  花鼠笔名金花鼠、五谈眉、花栗鼠,是一种松鼠科鼠类,为微型半树栖半地栖动物,主要栖息于山区与平原的针叶林、针阔混交林以及阔叶林和多灌丛地区。花鼠是独一在古北界踱步的花鼠属物种,海外主要踱步于俄罗斯西伯利亚、蒙古、朝鲜和日本,国内则主要踱步于长江以北的广地面区。花鼠算作进军的差别贮藏鼠类,在植物种子扩散、幼苗建成、种群彭胀以及丛林更新中具有举足轻重的作用。放置当今,针对花鼠的商榷主要围绕生物学特质、举止、生态和系统地舆学等;而该物种的基因组测序仍有很大的空缺,制约了花鼠遗传和进化机制的商榷。

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  据先容,科研团队概括欺诈因好意思纳公司测序、第三代单分子及时测序和染色体交互拿获等多种时间,初次拼装了一只捕自内蒙古赤峰市旺业甸林场的雌性花鼠的染色体水平基因组。基于转录组把柄、同源搜索等对基因组进行了分析,展望取得25311个卵白编码基因,其中94.73%的基因取得功能凝视。这些赶走标明花鼠基因组具有较高的竣工性和准确性,概括拼装质料达到高水平。

  科研团队通过基因组结构凝视分析判定重叠序列共1.03Gb,占花鼠全基因组的38.87%。染色体共线性分析发现,花鼠与其他两个具有染色体水平基因组的物种北松鼠和北好意思灰松鼠具有很强的同源性,同期,也发现了松鼠基因组进化经由中具有染色体重排的风物。除此以外,商榷组接受花鼠在内的20个代表性物种进行同源基因家眷阻塞,共阻塞出20个物种共有基因家眷20952个以及花鼠独到的基因家眷148个,这为细则花鼠的系统发育地位和进化历史提供了有用的分子数据。

  《光明日报》( 2023年01月06日 08版)日本鬼父第三季